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Épidémie de streptocoque du groupe M / emm causant une maladie invasive au Canada

lundi, juillet 2nd, 2018 | Eric | Psychanalyse

Contexte L’incidence de la maladie invasive à streptocoques du groupe A peut varier dans le temps et la région géographique, reflétant possiblement la sensibilité de la population à des souches particulières, mais aussi la variation des types M / emm prédominants. Méthodes Les isolats de GAS invasifs sont soumis par les laboratoires de santé publique du Canada au Centre national du streptocoque pour le typage M / emm. L’âge, le sexe, l’emplacement géographique et la source anatomique de l’isolat sont fournis avec l’isolat. la prévalence a augmenté, des données cliniques ont été recueillies sur des cas de M / emm capturés en Alberta et comparés à d’autres types de M / emm présents dans cette province. Résultats De janvier à décembre,% des cas invasifs de SGA ont été identifiés comme M / emm: Colombie-Britannique, de l’Alberta, de la Saskatchewan, du Manitoba, de l’Ontario, du Québec, du Nouveau-Brunswick, en La présentation clinique prédominante était le taux de bactériémie suivie de cellulite. Par rapport aux cas concomitants de maladie invasive à SGA provoquée par tous les autres types de M / emm, les facteurs de risque identifiés de maladie de M / emm étaient le rapport de cotes d’abus d’alcool tadalafil. [OU], ; % intervalle de confiance [IC], -, sans-abri OU,; % CI, -, infection par le virus de l’hépatite C OU, % IC, -, et l’usage de drogues illicites OU; % IC, -Conclusions L’Ouest canadien a été témoin de l’émergence rapide d’une souche rare de SGA causant des maladies invasives, principalement dans une population sélectionnée de personnes défavorisées

Streptocoques du groupe A GAZ; également connu sous le nom de Streptococcus pyogenes provoquent une variété de maladies allant de la pharyngite non-vie à la fasciite nécrosante et syndrome de choc toxique streptococcique La protéine M, qui est codée par le gène emm, est un facteur de virulence important et est également un marqueur épidémiologique est utilisé dans le monde entier pour caractériser les isolats de SGA Une corrélation a été trouvée entre certaines manifestations spécifiques de la maladie, l’âge des patients et les types de M / emm Par exemple, le syndrome de choc toxique streptococcique et la fasciite nécrosante sont particulièrement associés. Au Canada, le type M le plus répandu parmi les échantillons cliniques depuis le début de l’étude a été M / emm M a également été le plus répandu dans les pays à revenu élevé comme les États-Unis et ceux d’Europe [, ,,] Avant, les souches de GAS M / emm étaient rarement décrites comme une cause d’infections chez les humains Nous rapportons ici l’émergence de GAS M / emm envahissant au Canada de à

Méthodes

Collecte d’isolats et de données démographiques Le National Centre for Streptococcus situé à Edmonton, en Alberta, a fourni des services de référence nationaux canadiens pour le typage et le typage du GAS M, car il y a des provinces et des territoires au Canada. La maladie invasive à SGA est une maladie à déclaration obligatoire au Canada Les laboratoires de microbiologie clinique doivent soumettre des isolats d’infections invasives à SAG au Centre national de dépistage du streptocoque pour le typage M / emm lorsque ces isolats sont trouvés. Un site normalement stérile Les données disponibles pour le National Center for Streptococcus se limitent aux descripteurs de localisation géographique, à la date de naissance, au sexe et à la source anatomique de l’isolat.Les isolats de GAS précédemment identifiés par les laboratoires de microbiologie clinique ont été confirmés par β hémolyse. gélose au sang de mouton, groupement d’antigène glucidique, La typologie M et T sérologique a été réalisée comme décrit ailleurs En septembre, le Centre national de Streptococcus a remplacé le typage M sérologique par le séquençage du gène emm. Le test de typage EMM a été réalisé comme décrit. par Beall et al , et les séquences emm ont été comparées avec la banque de données Centers for Disease Control and Prevention http: // wwwcdcgov / ncidod / bio tech / strep / strepblasthtmAntibiotic susceptibilité a été réalisée et interprétée en utilisant des méthodes de diffusion de disque de référence comme décrit par Clinical Laboratoire des normes de laboratoire Les tailles des zones de diffusion des disques ont été utilisées pour interpréter la susceptibilité au SGA sur la base des lignes directrices Les agents antimicrobiens suivants ont été dosés: pénicilline, chloramphénicol, érythromycine, clindamycine et vancomycine. , Oxoid, EnglandCollecte de données cliniques En Alberta, la maladie invasive à SGA est une maladie à déclaration obligatoire Le Bureau du médecin hygiéniste en chef des cas de maladie invasive à SGA a été identifié par le laboratoire de diagnostic ou le médecin du patient et a fait l’objet d’une enquête approfondie par le médecin hygiéniste ou son représentant. le personnel a été signalé en utilisant le formulaire de rapport sur la maladie, incluant le nom du patient, l’âge et le lieu de résidence, ainsi que la maladie et les facteurs de risque du patient. mellitus, virus de l’hépatite C, virus de l’immunodéficience humaine, infection par le VIH, itinérance, consommation de drogues illicites, immunodépromotion, infection post-partum, infection de plaie chirurgicale, infection non chirurgicale, aucun cas identifié, inconnu et autres cas de M / emm au Canada. un comparateur pour la répartition selon l’âge et le sexe et la comparaison des chronologies M / emm a été choisi pour comparer avec M / emm, car M / emm était le type M le plus comparable à M / emm en ce qui concerne les numéros de cas durant la période d’analyse et est généralement le type M / emm le plus commun rapporté dans CanadaStatistical analysis Les différences entre les groupes ont été comparées à l’aide du test or ou du test exact de Fisher. Les analyses statistiques ont été effectuées à l’aide du logiciel SAS, version SAS Institute P values ​​& lt; ont été considérés comme indiquant une signification statistique

Résultats

GeographyFigure montre la répartition provinciale des cas de M / emm de à Il y a eu des cas de maladie de GAS envahissante capturés de septembre à novembre, incluant de la province de Québec et de l’Ontario De janvier à décembre,% des cas canadiens de maladie invasive à SGA ont été attribués à M / emm, avec la majorité de M / emm survenue dans la moitié ouest du pays. Il y a eu des cas de M / emm% de cas de maladie invasive à SGA de la Colombie-Britannique,% de l’Alberta,% de Saskatchewan ,% du Manitoba,% de l’Ontario et% du Québec Parmi les isolats de l’Ontario, provenaient de la région du Nord-Ouest de la province La majorité des cas [%] du Québec ont été identifiés comme se produisant au cours de la même période , il y avait des isolats isolés provenant du Nouveau-Brunswick, de Terre-Neuve, du Yukon et du Nunavut

Figure Vue largeTéléchargeGraphique illustrant le calendrier et les numéros de cas des cas invasifs de M / emm de janvier à décembre, ainsi que la province d’origine pour chacun des cas AB, Alberta; C.-B., Colombie-Britannique; MN, Manitoba; NB, Nouveau-Brunswick; NF, Terre-Neuve; NU, Nunavut; ON, Ontario; PQ, Québec; SK, Saskatchewan; YK, YukonFigure View largeTélécharger slideGraph illustrant le calendrier et les numéros de cas des cas invasifs M / emm de janvier à décembre, ainsi que la province d’origine pour chacun des cas AB, Alberta; C.-B., Colombie-Britannique; MN, Manitoba; NB, Nouveau-Brunswick; NF, Terre-Neuve; NU, Nunavut; ON, Ontario; PQ, Québec; SK, Saskatchewan; YK, YukonAnalyse des données de à septembre seulement des isolats de M / emm au Canada de, isolats soumis Un a été recueilli du Québec en avril et l’autre a été recueilli de l’Ontario en décembre Caractéristiques démographiques Différents types de M / emm ont été identifiés au Canada Les types de M / emm les plus fréquents observés au cours de cette période sont représentés sur la figure. De à, M / emm était le type M le plus répandu au Canada, représentant% en et diminuant à% en In, M / emm est devenu le type le plus répandu, représentant% des isolats et diminuant à

Figure Vue largeTélécharger les principaux types de M / emm déterminés par les isolats envahissants de streptocoque du groupe A soumis au National Center for Streptococcus pour le typage M / emm, -, Canada Tous les isolats de streptocoques du groupe A de – ayant subi un typage M / emm ont été totalisés Les principaux types de M / emm ont ensuite été répartis par nombre d’isolats pour,,,,, et Figure Vue largeDownload slideLes meilleurs types M / emm déterminés par des isolats invasifs de streptocoques du groupe A soumis au National Center for Streptococcus pour typage M Tous les isolats de Streptocoque du groupe A provenant de – qui ont subi un typage M / emm ont été totalisés par type, et les types M / emm supérieurs généraux ont ensuite été répartis par nombre d’isolats pour,,,, et M / emm cas, l’âge a été rapporté pour les cas% et le sexe a été rapporté pour% Figure Le rapport des hommes aux femmes était: pour M / emm et: pour M / emm Il y avait M / emm cas% chez les enfants âgés de & lt; an; Pour M / emm, seuls les cas% sont survenus dans le même groupe d’âge Figure Quatre-vingt dix pour cent de tous les cas de M / emm sont survenus chez des individus âgés ≥ ans, comparé à M / emm, pour lequel% des cas sont survenus

Figure Vue largeDownload slideInvasive groupe A Streptocoque M / emm et M / emm cas, par âge et sexe, – Pour M / emm A, il y avait des cas avec l’âge du patient identifié et avec le sexe du patient identifié Pour M / emm B, il y avait Les cas avec l’âge du patient ont été identifiés et le sexe du patient a été identifié. Pour les cas de M / emm A, il y avait des cas avec l’âge du patient identifié et avec le Le sexe du patient identifié Pour M / emm B, il y avait des cas avec l’âge du patient identifié et le sexe du patient identifiéFigure compare le nombre de cas de M / emm et M / emm pendant les années étudiées Il y a une périodicité saisonnière associée à M / emm , avec un pic prévisible de décembre à mars et un nadir d’août à octobre En revanche, les cas de M / emm ne présentaient pas de périodicité et se présentaient comme un seul grand groupe au cours de –

Figure Vue largeTélécharger la diapositive Comparaison des cas M / emm A et M / emm B de à, par mois d’isolationFigure View largeTélécharger diapositive Comparaison des cas M / emm A et M / emm B de à, par mois de isolationSource et caractérisation de M / emm emm isolatesTable montre la source anatomique des isolats de M / emm. Un total de% d’isolats provenait d’hémoculture, et% provenaient d’aspirats articulaires et d’échantillons d’abcès ou de tissus mous. Seuls des isolats ont été prélevés dans des échantillons de liquide céphalorachidien; l’un d’entre eux provenait d’un spécimen post-mortem M / emm était plus fréquemment isolé des spécimens de l’articulation et de l’abcès ou des tissus mous que les autres types de M / emm% vs%; P & lt; En revanche, d’autres types de M / emm étaient plus fréquemment isolés des échantillons de sang que M / emm% vs%; P & lt;

Comparaison de M / emm et de tous les autres types M / emm d’isolats infiltrants de streptocoque du groupe A, de janvier à décembre, CanadaTable View largeDownload slideSource Comparaison de M / emm et de tous les autres types M / emm d’isolats invasifs de streptocoques du groupe A, Janvier -décembre, Canada Tous les isolats étaient sensibles à la pénicilline, au chloramphénicol, à l’érythromycine, à la clindamycine et à la vancomycine. L’analyse sérologique de type T a révélé que tous les isolats de M / emm prélevés étaient T ou T. En Alberta, les données cliniques étaient disponibles pour% Ces cas ont été comparés à tous les autres cas de M / S invasive SGA en Alberta de à Il y avait des cas de maladie invasive SGA non M / emm pour lesquels des données cliniques étaient disponibles. la présentation pour tous les cas de M / emm était bactériémie M / emm,%; tous les autres types de M / emm,% Tableau Des différences significatives ont été notées pour la cellulite% des cas M / emm vs% des cas dus à tous les autres types M / emm; P = et infection commune% vs%; P = Table

Vue de la table grandDownload slide Comparaison du diagnostic à la présentation de M / emm et de tous les autres cas de M / emm de l’infection streptococcique du groupe A en Alberta, Canada, pour lesquels des informations cliniques étaient disponibles, janvier -décembre Voir la table largeTélécharger la comparaison du diagnostic à la présentation de M / emm contre tous les autres cas M / emm d’infection à streptocoque du groupe A en Alberta, Canada, pour lesquels des informations cliniques étaient disponibles, janvier-décembre Le tableau présente les facteurs de risque et les rapports de cotes associés à M / emm par rapport aux autres M / emm En Alberta, les principaux facteurs de risque de contracter la maladie invasive à SMA, la comparaison avec tous les autres cas de maladie invasive à S / M, étaient l’abus d’alcool OU; % intervalle de confiance [CI], -; P & lt; sans-abri OU,; % CI, -; P =, infection par le VHC OU, % CI, -; P =, et l’usage de drogues illicites OU; % CI, -; P =

Vue de la table grandDownload Facteurs de risque pour M / emm et tous les autres cas d’infection à streptocoque du groupe A en Alberta, Canada, janvier -décembre Voir la diapositive grandDownload Facteurs de risque pour M / emm et tous les autres cas d’infection par streptocoque du groupe A en Alberta, Canada, janvier-décembre

Discussion

La documentation sur l’usage de drogues illicites comme facteur de risque de maladie invasive à SGA est semblable aux rapports précédents qui ont décrit une augmentation des cas de maladie invasive à SGA en association avec des utilisateurs de drogues injectables Un rapport du Royaume-Uni décrit des taux accrus de Fait intéressant, contrairement à notre épidémie, les cas du Royaume-Uni n’étaient attribués à aucun type de M / emm, mais plutôt à plusieurs types M, M a provoqué une proportion plus élevée de la maladie dans la population utilisatrice de drogues injectables que dans la population non utilisatrice de drogues injectables Les données tirées de l’étude du Royaume-Uni suggèrent que l’augmentation des infections invasives à SGA chez les toxicomanes par voie intraveineuse infections sporadiques et en grappes Les chercheurs ont été incapables de fournir une explication claire de l’augmentation Une autre enquête sur la maladie invasive à SGA Des utilisateurs de drogues injectables ont été observés à Barcelone, en Espagne, durant les saisons automnales de, et Semblable aux résultats britanniques, aucun type M n’a été attribué aux foyers; Cependant,% des cas de ces groupes ont été attribués à un seul clone. Sans surprise, les patients d’Espagne avaient un taux d’infection par le VHC de% et un taux d’infection par le VIH de% -conditions souvent associées à l’utilisation de drogues injectables. Cela contraste fortement avec notre groupe d’étude clinique de cohorte M / emm de l’Alberta, qui avait un taux d’infection de VIH de% et un taux d’infection par le VHC de%, indiquant que bien que la consommation de drogues illicites soit un facteur de risque important. L’analyse des facteurs de risque de l’Alberta a montré que l’abus d’alcool, l’itinérance, l’infection par le VHC et la consommation de drogues illicites sont des facteurs de risque majeurs, ce qui laisse croire que l’épidémie de M / emm était très axée sur population défavorisée spécifique Encore une fois, cela contraste avec M / emm, qui cible généralement une population générale plus large dans son ensemble plutôt qu’un groupe spécifique. Une population ciblée peut aussi être soutenue par l’âge. La distribution d’âge M / emm est plus large dans le spectre de l’âge, alors que la distribution d’âge M / emm est plus centrée sur les individus d’âge moyen – une population plus susceptible d’être associée à la consommation de drogues illicites, l’itinérance et l’abus d’alcool. une éclosion d’ecthyma impliquant une souche de MAS extrêmement infectieuse en Israël a révélé un facteur de risque majeur de surpeuplement avec de mauvaises conditions d’hygiène Des observations similaires sont reflétées dans l’épidémie impliquant M / emm décrite ici, avec un grand nombre d’infections de cellulite dans une population défavorisée avec Probablement moins bonne hygiène Il est intéressant de noter que l’augmentation soudaine des cas impliquant M / emm n’a pas entraîné le remplacement d’autres types M / emm, mais semble plutôt se produire en plus des types M / emm déjà en circulation. emm à M / emm, généralement le type M / emm le plus répandu en Amérique du Nord, M / emm était assez constant en nombre d’isolats récupérés au Canada de à, sans diminution majeure ou inc. Ce qui contraste avec M / emm, qui présentait une courbe épidémique claire de à Une des forces de l’étude est la capacité d’un laboratoire centralisé de typage du GAS à documenter les changements épidémiologiques majeurs dans les GAS invasifs. Si le typage M / emm était régionalisé, la capture des cas de M / emm aurait pu être difficile et l’ampleur de l’épidémie pourrait ne pas être reconnue. Ce n’est pas la même chose pour la saisie des données cliniques de la maladie invasive à SGA. ces données ne sont pas centralisées. Néanmoins, pour fournir des données cliniques importantes sur l’épidémie, nous avons recueilli des données de l’Alberta, qui représentaient% des cas au Canada. Bien que ne fournissant pas une image nationale, elle fournit une description claire des cas en Alberta. province ayant un nombre important de cas Nous n’avons pas déterminé pourquoi le nombre de cas de M / emm a augmenté, pourquoi le nombre a diminué ou pourquoi l’épidémie était concentrée dans l’ouest du Canada Altho Le fait que les clones de GAZ causant des maladies aient été des événements bien connus dans le passé, les raisons de ces derniers n’ont jamais été bien définies Il a été suggéré que l’émergence d’un nouveau clone pourrait évoluer lentement à travers l’accumulation. de mutations ponctuelles ou par acquisition de nouveau matériel génétique par des transferts horizontaux de gènes Une diminution de la prévalence d’un clone particulier peut résulter d’une diminution de la virulence, d’une augmentation de l’immunité collective et / ou du remplacement du sérotype par un clone plus «en forme» [,,] En conclusion, nous avons documenté une seule et importante épidémie de la maladie invasive à SGA au Canada causée par une seule souche unique de SGA invasif. L’épidémie en Alberta ciblait principalement un groupe défavorisé composé de: les sans-abri, les consommateurs de drogues illicites, les abus d’alcool

Remerciements

Nous remercions Sipi Garg pour son aide dans le calcul des données statistiques Nous sommes redevables à la vigilance des laboratoires de microbiologie diagnostique aiguë au Canada pour l’identification et l’acheminement des SGA invasifs vers leurs laboratoires provinciaux. Soutien financier Le Centre national pour le streptocoque a été financé en partie par la Microbiologie nationale. Laboratoire, Winnipeg, Manitoba et Alberta Health Services, Alberta pour ce travailPopuls conflictuels potentiels Tous les auteurs: no conflicts