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Salmonella non-typhoïde provenant de cas cliniques humains, d’enfants asymptomatiques et de viandes au détail crues au Yucatan, au Mexique

Contexte Nous présentons les résultats d’une étude de surveillance des salmonelloses menée sur une année; enfants asymptomatiques; Les isolats ont été caractérisés en fonction du sérotype, de la sensibilité aux antimicrobiens et de la parenté génétique avec l’électrophorèse sur gel en champ pulsé. Résultats Salmonella Typhimurium était le sérotype le plus fréquemment trouvé chez les humains% d’isolats, suivi de Salmonella Agona % d’isolats Salmonella Enteritidis était un sérotype mineur% d’isolats Enfants asymptomatiques portés S Agona% d’isolats, Salmonella Meleagridis% d’isolats, Salmonella Anatum% d’isolats et S Enteritidis% d’isolats Un pourcentage élevé d’échantillons de viande vendue au détail contenait Salmonella; il a été observé le plus souvent dans le porc% des échantillons, suivi du bœuf% des échantillons et de la volaille% des échantillons Résistance aux médicaments oraux utilisés pour le traitement de la salmonellose pour l’ampicilline% des isolats étaient résistants, chloramphénicol% des isolats et triméthoprime Vingt-sept pour cent des isolats étaient résistants à l’acide nalidixique, et aucun n’était résistant à la ciprofloxacine. La résistance multirésistante était plus fréquente chez les isolats des sérotypes S Typhimurium et S Anatum. L’électrophorèse en champ pulsé a montré que les souches trouvées dans les viandes vendues au détail étaient génétiquement identiques aux souches trouvées chez les enfants asymptomatiques et les patients malades. Conclusions Notre étude a révélé une forte prévalence de Salmonella dans les viandes vendues au détail et les infections entériques; bon nombre de ces isolats étaient résistants aux antimicrobiens cliniquement importants Une sélection aléatoire d’isolats provenant de personnes et de viande vendue au détail a montré une parenté génétique, ce qui suggère qu’au Yucatan, un transfert considérable de Salmonella se produit à travers la chaîne alimentaire

Salmonella peut causer une gastro-entérite chez les personnes de tout âge et de graves maladies invasives chez les nourrissons, les personnes âgées et les personnes immunodéprimées Au cours des dernières décennies, l’incidence des infections à salmonelles d’origine alimentaire par les zoonoses En outre, la fréquence de la résistance aux antimicrobiens et le nombre de déterminants de la résistance à Salmonella ont nettement augmenté En réponse à la menace croissante de foyers d’infection et de résistance aux agents pathogènes d’origine alimentaire, les pays industrialisés ont établi programmes de surveillance intersectoriels et multidisciplinaires Ils ont également mis en œuvre de nombreuses interventions coûteuses visant à réduire ou à éliminer l’infection ou la colonisation par Salmonella et d’autres agents pathogènes d’origine alimentaire chez les animaux d’alimentation et les aliments d’origine animale. ase très peu ont établi des programmes de surveillance intersectorielle pour Salmonella En Amérique latine, les réseaux de surveillance sont généralement limités aux échantillons prélevés sur des personnes et la plupart des réseaux reposent sur des systèmes de surveillance passive déficients. Pour les salmonelles et les modes de transmission On en sait encore moins sur la résistance aux antimicrobiens des souches d’origine alimentaire de Salmonella, l’étendue de sa transmission aux humains et le fardeau de santé publique de la salmonellose, parmi les états les plus pauvres du Mexique, a l’un des taux de morbidité les plus élevés pour les maladies intestinales infectieuses chez les enfants; des cas de maladie intestinale infectieuse par an et par an; D Ruiz, Département de la santé publique du Yucatan, communication personnelle La production d’aliments pour animaux est l’une des activités économiques majeures du Yucatan et ~% de toute la viande vendue dans l’Etat est produite localement compte tenu de l’importance des maladies zoonotiques d’origine alimentaire. Les objectifs et la structure du programme de surveillance étaient fondés sur les recommandations d’un comité d’experts techniques de l’Organisation mondiale de la santé et adaptés aux besoins et aux infrastructures locales. Les principaux objectifs du programme étaient de déterminer la prévalence de Salmonella dans les personnes malades et en bonne santé et dans la vente au détail de porc, de poulet et de bœuf; déterminer les principaux sérovars isolés de chaque source et leurs profils de sensibilité aux antimicrobiens; et pour déterminer la parenté génétique des isolats provenant des personnes et de la viande vendue au détail. Cet article décrit les résultats obtenus et leurs implications pour la santé publique et la recherche future.

Matériaux et méthodes

Prélèvement d’échantillons Au cours de la première année, la surveillance a été limitée aux personnes malades et aux enfants asymptomatiques; Les enfants asymptomatiques ont été inclus pour donner une perspective plus large du taux de transmission et de transport de Salmonella dans la population générale. Des échantillons fécaux ont été prélevés chez des patients souffrant de diarrhée traités unité de réhydratation orale ou département d’urgence pédiatrique d’un hôpital central d’État situé dans la capitale, ou dans un centre de soins primaires d’une ville voisine, et d’enfants asymptomatiques fréquentant des garderies ou des jardins d’enfants dans tout le Yucatan Les enfants en bonne santé qui fréquentaient régulièrement la crèche ou la garderie et qui ne présentaient pas de diarrhée quelques jours avant la présentation d’un échantillon de matières fécales étaient considérés comme asymptomatiques. Le comité d’examen interne Horan et le comité d’éthique ont approuvé le protocole et les Tous les participants ou leurs tuteurs ont acheté du poulet, du porc et du bœuf de détail dans des supermarchés, des boucheries et / ou des marchés ouverts dans les villes où résidaient les malades et les enfants asymptomatiques. Microbiologie Isolement et identification des salmonelles à partir d’échantillons d’excréments humains et la viande vendue au détail a été effectuée selon les méthodes décrites ailleurs usqu’à ce que des colonies de Salmonella aient été prélevées sur les plaques d’isolement primaires aux fins d’identification; Les isolats ont été testés selon la méthode de diffusion sur disque pour la sensibilité à l’ampicilline, au chloramphénicol, à la ceftriaxone, à la ciprofloxacine, à la gentamicine, à la kanamycine, à l’acide nalidixique, à la streptomycine, au sulfisoxazole et à la triméthoprime. Les CMI de sulfaméthoxazole et de tétracycline ont été déterminées par microdilution en bouillon pour des isolats sélectionnés, selon les protocoles et les critères d’interprétation de l’Institut de normes cliniques et de laboratoire anciennement NCCLS PFGE Pour déterminer la parenté génétique des isolats de Salmonella trouvés dans des échantillons humains et humains. Les résultats du PFGE ont été analysés à l’aide du logiciel BioNumerics, version Applied-Maths, Kortrijk, Belgique, et les patrons de bandes ont été comparés. utilisant des coefficients de dés avec une position de bande% toleranceDataData Logiciel Whonet, version L’Organisation Mondiale de la Santé a été utilisée pour entrer des données et analyser les profils de sensibilité par sérotype

Résultats

Surveillance épidémiologique Des échantillons fécaux ont été prélevés chez des patients atteints de diarrhée âgés de plusieurs mois hospitalisés à l’hôpital General O’Horan ou traités dans une clinique de soins de proximité proche et chez des enfants asymptomatiques âgés de plusieurs mois ayant fréquenté différentes écoles ou garderies dans Les échantillons de poulet, les échantillons de porc et les échantillons de boeuf ont été achetés dans les supermarchés, les boucheries ou les marchés au détail. Le porc au détail a la plus forte prévalence d’échantillons de Salmonella%, suivi par le bœuf% et la volaille% Porc contenu & gt; sérotype par échantillon, plus fréquemment que le poulet ou le boeuf vendus au détail La prévalence de Salmonella dans les volailles provenant de marchés ouverts était de% d’échantillons, contre% pour des échantillons provenant de boucheries et de% pour des échantillons provenant de supermarchés. % de pour les échantillons provenant des marchés,% de pour les échantillons provenant des boucheries, et% de pour les échantillons des supermarchés, La prévalence de Salmonella dans le bœuf était% des marchés,% des boucheries, et% des supermarchés

Tableau View largeTélécharger slidePrévalence de l’infection à Salmonella chez l’homme et contamination de la viande au détail du Yucatan, Mexique, -Table View largeTélécharger slidePrévalence de l’infection à Salmonella chez l’homme et contamination de la viande au détail du Yucatan, Mexique, -Salmonella a été récupérée chez% des personnes , avec les taux mensuels de récupération les plus élevés% -% de personnes enregistrées de juin à octobre Bien que le taux moyen de récupération des enfants asymptomatiques durant la période étudiée soit de%, les taux de récupération varient considérablement d’une école à l’autre. -% Cependant, il n’y avait pas de regroupement par ville ou niveau socioéconomique Trois enfants atteints de diarrhée et d’enfants asymptomatiques portaient différents sérotypes de Salmonella, et différents sérotypes ont été trouvés dans chaque échantillon fécal d’autres enfants asymptomatiquesLes sérotypes les plus fréquemment isolés des personnes malades, les enfants asymptomatiques, et les viandes de détail sont présentés dans la table Salmon ella Agona et Salmonella Meleagridis étaient les sérovars les plus communs isolés de toutes les sources d’échantillons Parmi les viandes vendues au détail, Salmonella Typhimurium était principalement isolé du porc% des isolats et Salmonella Enteritidis était le deuxième sérotype le plus prévalent chez le poulet% d’isolats

Tableau View largeTélécharger les sérotypes de Salmonella les plus couramment isolés chez les personnes infectées et les sources alimentaires au Yucatan, Mexique, -Table View largeTélécharger slideSalmonella sérotypes les plus couramment isolés chez les personnes infectées et les sources alimentaires au Yucatan, Mexique, -Résistance aux antimicrobiens Les pourcentages d’isolats provenant des différentes sources Dans l’ensemble, l’antimicrobien le plus commun auquel les différents sérovars de Salmonella étaient résistants était la streptomycine. Les isolats étaient résistants, suivis par le tétracycline%, le sulfisoxazole% et l’acide nalidixique. Médicaments administrés par voie orale, tels que l’ampicilline%, le chloramphénicol% et le triméthoprime-sulfaméthoxazole% Résistance aux céphalosporines de troisième génération détectée pour la première fois et limitée à S. Typhimurium% des isolats étaient résistants Aucun isolat n’était résistant à la ciprofloxacine Résistance à l’ampicilline, au chloramphénicol et la triméthoprime-sulfaméthoxazole était la plus fréquente chez les isolats de personnes atteintes de diarrhée et d’isolats de porc. La résistance à la gentamicine était plus courante chez les isolats de porc et la résistance à l’acide nalidixique était plus fréquente chez les isolats de poulet et de boeuf

Tableau View largeTélécharger la résistance aux antimicrobiens chez les isolats de Salmonella provenant de fèces humaines et de viande vendue au Yucatan, Mexique, -Table View largeTélécharger la résistance aux antimicrobiens chez des isolats de Salmonella provenant de fèces humaines et de viande vendue au détail au Yucatan, au Mexique. Certains sérovars étaient presque tous sensibles: Salmonella Infantis, Salmonella Weltevreden et Salmonella Braderup. Le pourcentage d’isolats résistants à l’acide nalidixique, précurseur de la résistance aux fluoroquinolones, était très élevé parmi les isolats de Salmonella Albany% et S Enteritidis% parmi nos sujets humains, et parmi S Albany% et S Enteritidis% isolats du poulet La résistance multidrogue était plus fréquente chez les isolats S Anatum et S Typhimurium Soixante-huit pour cent des isolats S Anatum n = et% des isolats S Typhimurium n = étaient résistants au moins aux antimicrobiens; et% d’isolats S Anatum multirésistants et% d’isolats S Typhimurium multirésistants étaient résistants aux antimicrobiens The Les taux de résistance des isolats de S Typhimurium provenant de patients malades, d’enfants asymptomatiques et de porc sont présentés dans le tableau et comparés avec données disponibles provenant d’autres pays d’Amérique du Nord et d’Amérique latine

Tableau View largeTélécharger la résistance aux antimicrobiens de Salmonella Typhimurium isolée de personnes malades et de viande vendue au détail en Amérique du Nord et en Amérique latine, -Table View largeTélécharger slideAntimicrobial resistance in Salmonella Typhimurium isolée de personnes malades et de viande vendue au détail en Amérique du Nord et en Amérique latine, -PFGE des isolats de S Typhimurium, des isolats de S Agona, des isolats de S Albany et des isolats de S Enteritidis provenant de sujets humains et de viande vendue au détail n = ont été sélectionnés pour l’analyse moléculaire Les profils PFGE montrent des groupes A-D isolés selon le sérotype. Des sujets et des échantillons de viande de détail ont été trouvés pour chaque sérotype Sept souches de S Agona pansusceptibles avec des profils de PFGE identiques, des profils ont été isolés chez des patients malades et des enfants asymptomatiques, ainsi que chez le porc et le poulet. Agona cluster de souches trouvées dans les isolats de Le poulet, le porc et une personne malade présentaient des profils PFGE identiques Les isolats de ce groupe étaient pansusceptibles à l’exception du CVM, qui était résistant aux antimicrobiens Les isolats S Typhimurium du groupe B, d’un échantillon de poulet vendu au détail et d’échantillons de diarrhée, tous avaient des motifs de PFGE identiques et le phénotype de résistance typique de S Typhimurium DT, résistance aux médicaments ampicilline, chloramphénicol, streptomycine, sulfaméthoxazole et tétracycline Un second groupe d’isolats de S Typhimurium ayant des patrons de PFGE identiques et des antibiogrammes similaires a été retrouvé chez le porc échantillon et échantillons de personnes malades

Figure Vue largeDownloadrogramme des profils PFGE pour des isolats sélectionnés de Salmonella du Yucatan, Mexique La résistance aux antimicrobiens, indiquée par une boîte noire, était présente pour amoxicilline-clavulanate AMC, ampicilline AMP, céfoxitine FOX, céphalothine CEP, chloramphénicol CHL, acide nalidixique NAL, streptomycine STR, sulfaméthoxazole SMX, tétracycline TET et triméthoprime-sulfaméthoxazole COT Les sources des isolats testés étaient les enfants asymptomatiques A, les personnes souffrant de diarrhée D, la viande de porc vendue au détail P et la viande de poulet vendue au détail CFigure View largeTendrogramme des patrons de PFGE pour des isolats sélectionnés de Salmonella La résistance aux antimicrobiens, indiquée par une boîte noire, était présente pour amoxicilline-clavulanate AMC, ampicilline AMP, céfoxitine FOX, céphalothine CEP, chloramphénicol CHL, acide nalidixique NAL, streptomycine STR, sulfaméthoxazole SMX, tétracycline TET et triméthoprime-sulfaméthoxazole COT Les sources des isolats testés étaient des enfants asymptomatiques A, pers les cas de diarrhée D, de viande de porc vendue au détail et de viande de poulet vendue au détail CCluster C contenaient des isolats de S Albany apparentés ayant au moins% de patrons de PFGE d’identité, et incluaient des isolats provenant de viande de poulet et de sujets humains et présentant des profils PFGE identiques. antibiogrammes similaires Parmi les isolats de S Enteritidis, les profils PFGE et sont très étroitement liés & gt;% identité et représentent des souches avec des phénotypes de résistance ⩽, qui ont été isolés de la viande de poulet et des enfants asymptomatiques

Discussion

Les cations représentent ~% de la population La plupart des viandes vendues dans l’état sont fournies par des producteurs locaux et, à ce jour, nous n’avons pas observé de changements majeurs dans la prévalence de l’infection et de la colonisation par Salmonella ou dans les sérotypes de Salmonella isolés. En outre, comme notre hôpital est un centre de référence régional, il est raisonnable de supposer que nos sujets malades sont caractéristiques des patients atteints d’une infection à Salmonella dans tout l’État qui nécessitent une hospitalisation. A notre connaissance, voici le premier rapport d’Amérique latine pour déterminer simultanément la prévalence de Salmonella chez les humains et les aliments de la même région géographique Une recherche bibliographique des dernières années montre qu’il existe peu de données qui établissent une association entre la prévalence de Salmonella dans les viandes de détail et la prévalence de Diarrhée associée aux salmonelles De plus, il semble qu’il n’y ait pas de profils d’infection cohérents selon la région. s de pays industrialisés comme la Suisse t l’Italie ignalent que jusqu’à% et%, respectivement, de tous les cas de diarrhée hospitalière étaient associés à Salmonella, mais des études dans des pays en développement comme le Nigéria u Trinidad et Tobago rapporté des taux de% et de%, respectivement. Il est important de souligner que la plupart de ces études ont prélevé des échantillons d’hôpitaux de référence et n’ont donc pas pu estimer l’incidence de la diarrhée associée à Salmonella dans la population générale. À l’échelle mondiale, peu de données scientifiques permettent de déterminer si les sérotypes les plus répandus chez les humains sont ceux que l’on trouve le plus souvent chez les humains, ou si les sérotypes trouvés chez les humains constituent un sous-ensemble plus virulent des sérotypes de Salmonella circulants. et al nt utilisé un modèle mathématique pour comparer les sérotypes de Salmonella chez les humains malades avec ceux isolés chez les animaux destinés à l’alimentation. distribution des sérotypes, ce qui a conduit les chercheurs à se demander si le risque de transmission aux humains est égal pour toutes les catégories de produits alimentaires et si tous les sérotypes de Salmonella ont la même capacité à causer la maladie. D’autres études [,,] documentent des incohérences entre les Des exemples spécifiques incluent Salmonella Kentucky chez les volailles, Salmonella Dublin chez les bovins, et S Infantis et Salmonella Senftenberg chez les porcs Ces incohérences dans la distribution des sérotypes seront difficiles à résoudre par la surveillance de routine, et ils soulignent le besoin Pour des études prospectives basées sur la population afin de déterminer la contribution relative des différents sérotypes de Salmonella à la maladie humaine. En plus de la prévalence élevée des sérotypes de Salmonella chez les viandes et les humains, notre étude a également montré que les taux de résistance aux antimicrobiens étaient significativement plus élevés. taux dans industrializ Par exemple, les taux de résistance à l’acide nalidixique chez les isolats de S Enteritidis provenant de la viande de poulet au Danemark et aux États-Unis étaient respectivement de% et% et de% parmi les isolats provenant d’êtres humains des deux pays. De même, comme le montre le tableau, les taux de résistance au triméthoprime-sulfaméthoxazole et à l’acide nalidixique de S Typhimurium chez les humains et dans les aliments semblent être plus élevés Dans les pays latino-américains qu’aux États-Unis et au Canada Les différences de profils de résistance aux antimicrobiens parmi les sérotypes démontrent la nécessité d’une étude plus approfondie de l’utilisation des antimicrobiens aux niveaux humain et vétérinaire et des modes de transmission à travers la chaîne alimentaire. Le transfert fréquent de Salmonella se fait à travers la chaîne alimentaire, nous devrons surveiller de près l’impact sur la santé publique des Nous prévoyons un scénario similaire à ce qui s’est passé en Europe et en Amérique du Nord, où des études récentes ont documenté une association entre une infection par Salmonella résistante aux antibiotiques et un risque accru d’hospitalisation, d’infection sanguine et de mortalité. Il est probable que les nourrissons, qui sont les plus sensibles aux maladies diarrhéiques et qui n’ont pas encore acquis une immunité suffisante, en subiront le plus grand impact. Le transfert de salmonelles et d’autres agents pathogènes zoonotiques à l’homme via l’approvisionnement alimentaire est un problème de santé publique permanent cinétique. Nécessité pour les pays en développement de mettre en place des systèmes de surveillance intégrés pour surveiller la prévalence de Salmonella et ses profils de résistance chez les humains, la viande et les animaux destinés à l’alimentation humaine. d’antimicrobiens émergents la résistance

Remerciements

Nous remercions Robert Walker pour son examen critique de ce manuscrit. Soutien financier Administration des aliments et des médicaments des États-Unis Numéro de subvention FD-U- – Conflits d’intérêts potentiels Tous les auteurs: no conflicts