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Escherichia coli résistant au carbapénème hébergeant des β-lactamases de Klebsiella pneumoniae carbapénémases associées à des établissements de soins de longue durée

Neuf isolats d’Escherichia coli résistants au carbapénème hébergeant des enzymes KPC-2 ou KPC-3 de Klebsiella pneumoniae ont été identifiés chez des patients résidant dans 7 établissements de soins de longue durée distincts. Des β-lactamases de type CTX-M hydrolysant le céfotaxime ont également été documentées dans 3 isolats. l’identification de ces enzymes chez les patients séjournant dans des établissements de soins de longue durée devrait être une préoccupation majeure pour toutes les composantes des systèmes de soins de santé

La résistance aux carbapénèmes chez les membres des Enterobacteriaceae peut être causée par une variété de mécanismes, y compris les sérines ou les métallo-β-lactamases seules ou en combinaison avec la réduction des protéines porines [1] En 2001, une nouvelle carbapénémase a été rapportée chez Klebsiella pneumoniae, désigné KPC-1 [2] L’enzyme hydrolysait tous les antibiotiques β-lactamines, était inhibée par l’acide clavulanique et se trouvait sur un plasmide non conjugatif [2]. Plus récemment, la séquence de KPC-1 s’est révélée identique à celles de KPC-2 [3] KPC-2 à KPC-4 sont des β-lactamases non métallo-carbapénèm-hydrolysantes de classe moléculaire A, groupe fonctionnel 2f et ont été identifiées de plus en plus fréquemment chez K pneumoniae [4] documenté l’émergence des enzymes KPC dans K pneumoniae chez les patients dans notre établissement New York Hospital Queens et chez les patients dans le New Jersey, quelques descriptions de Escherichia coli abritant des β-lactamases KPC ont été rapportées [5, 6] Un rapport de l’United S En 2006, un rapport d’Israël a identifié des β-lactamases KPC-2 dans des isolats d’E. coli provenant de 4 patients [8]. En 2006, un rapport d’Israël a identifié des cas de résistance au carbapénème chez E. coli hébergeant le KPC-3. étaient génétiquement et épidémiologiquement indépendants Récemment, 7 isolats de E. coli portant des enzymes KPC-2 provenant de 3 hôpitaux de Brooklyn, New York, ont été décrits [9] Le ribotypage a révélé 3 clones, et 5 des isolats appartenaient au même ribotype. épidémiologie et sensibilité aux antibiotiques de 9 isolats de E. coli résistants au carbapénème cliniquement uniques provenant de patients résidant dans des établissements de soins de longue durée Méthodes Neuf isolats d’E. coli résistants au carbapénème provenant d’échantillons d’urine ont été identifiés au cours de la période 2004-2007; ces isolats ont été initialement identifiés par des méthodes de test de susceptibilité Kirby-Bauer utilisant des disques de méropénem dans le laboratoire de microbiologie clinique de notre institution. La résistance au carbapénème a été étudiée et la sensibilité des isolats à d’autres antibactériens a été déterminée par la méthodologie Etest. Les points de rupture AB Biodisk utilisés pour les tests de sensibilité étaient ceux recommandés par le Clinical Laboratory Standards Institute [10] ou ceux figurant sur l’étiquette du produit. Un seuil de sensibilité de 20 μg / mL a été utilisé pour la polymyxine B. On a analysé les β-lactamases spectrales et les métallo-β-lactamases à l’aide de bandes Etest BLSE et Etest MBL. On a analysé les isolats E. coli résistants aux carbapénèmes pour déterminer la présence de type CTX-M et ACT-1 hydrolysant le céfotaxime. enzymes par PCR, en utilisant les procédures décrites ailleurs [5, 6, 11] Produit d’amplification Des séquences positives pour la PCR ont été séquencées à l’aide d’un système automatisé. 3700 Applied Biosystems Des séquences ont été identifiées par le programme BLAST du site Web du National Center for Biotechnology Information [12] Résultats Le premier isolat a été identifié en novembre 2004 venaient d’hommes; Le tableau 2 détaille la sensibilité aux antibiotiques des 9 isolats d’E. coli résistant au carbapénème. Six des 9 isolats avaient une résistance intermédiaire ou étaient résistants à l’imipénème MIC,> 4 μg / mL, 4 avaient une sensibilité intermédiaire. résistance intermédiaire ou étaient résistants à la CMI méropénem,> 4 μg / mL, et tous étaient résistants à la CMI ertapénème,> 8 μg / mL Tous les isolats étaient non sensibles au CMI du doripénème,> 05 μg / mL [13] Tous les isolats étaient de 8 à 10 μg / mL et résistant à la ciprofloxacine, à la moxifloxacine, à la lévofloxacine, au céfotaxime, à la pipéracilline-tazobactam et à la rifampicine. Huit des neuf isolats avaient une résistance intermédiaire ou étaient résistants à la céfoxitine, au céfotétan et à la ceftazidime Sept des 9 isolats étaient résistants au triméthoprime-sulfaméthoxazole Des résultats variables de sensibilité ont été observés avec les aminoglycosides et la doxycycline. L’addition d’acide clavulanique au céfotaxime, à la ceftazidime et à Cefepime Les bandes ESBL n’ont pas démontré une réduction de 3 fois des CMI Aucune métallo-β-lactamase n’a été détectée par criblage avec des bandes de MBT Etest Les 9 isolats étaient positifs par PCR en utilisant des amorces dirigées contre KPC-2, une enzyme précédemment identifiée chez K pneumoniae isolats de notre hôpital et des hôpitaux de Brooklyn [5] Les études de séquençage ont révélé que 6 isolats hébergeaient le KPC-2 et 3 isolats KPC-3 possédés étaient négatifs pour l’enzyme ACT-1 par PCR. Les isolats 1, 3 et 6 étaient positifs La PCR utilisant les amorces CTX-M et le séquençage des isolats 3 et 6 ont révélé des enzymes CTX-M-15

Tableau 1View largeTélécharger les caractéristiques démographiques de 9 patients de 7 établissements de soins de longue durée et identification enzymatique de 9 isolats d’Escherichia coli résistants au carbapénème à partir de spécimens d’urine Tableau 1Voir grandDisquetter les caractéristiques démographiques de 9 patients de 7 établissements de soins de longue durée et identification enzymatique de 9 carbapénème isolats résistants d’Escherichia coli provenant d’échantillons d’urine

Des isolats de tractus urinaire provenant de 9 patients vivant dans 7 établissements de soins de longue durée Trois des isolats E coli hébergeant le CPK possédaient également des enzymes CTX-M Bien que les enzymes de type CTX-M aient été identifiées de plus en plus fréquemment. La présence simultanée des deux β-lactamases KPC et CTX-M dans 1 isolat de K pneumoniae [17] La ​​présence concomitante des deux β-lactamases dans 3 de nos isolats était inattendue, principalement en dehors des États-Unis. et il n’aurait pas été détecté dans le laboratoire de microbiologie clinique de routine sans utiliser les méthodes moléculaires. Tableau 1 Il est également intéressant d’un point de vue évolutif que les deux enzymes étaient présentes dans certains isolats en raison du large spectre d’activité hydrolysant les β-lactamines. Les enzymes KPC; ainsi, il est possible que la présence d’enzymes CTX-M ait précédé l’acquisition de β-lactamases KPC dans nos isolats. On pourrait aussi s’attendre à cette documentation, car il a été démontré qu’un plasmide possédant du blaCTX-M-15 porte des régions multirésistantes. transposons multiples et séquences d’insertion [18] Des rapports antérieurs de résistance au carbapénème dans des isolats d’E. coli à cause d’enzymes KPC n’ont pas décrit une telle occurrence. La documentation de nombreux isolats qui avaient une résistance intermédiaire ou résistaient à la céfoxitine et au céfotétane. La réduction des plis dans les CMI après l’addition de l’acide clavulanique au céfotaxime, à la ceftazidime et au céfépime peut être expliquée de plusieurs façons Dans la présente étude, nous avons sondé uniquement la présence de β-lactamases ACT-1, KPC et CTX-M par PCR. Des β-lactamases supplémentaires qui auraient pu surmonter les effets de l’acide clavulanique étaient susceptibles d’avoir été présentes. En outre, d’autres enzymes AMP-C à médiation plasmidique ne sont pas présentes. inhibé par des inhibiteurs de la β-lactamase peut également avoir été présent Ces facteurs ont été récemment rapportés dans un isolat de K pneumoniae possédant au moins 8 β-lactamases différentes [19] Les tests de sensibilité à l’Ertapenem ont correctement identifié la résistance au carbapénème dans les 9 isolats. été l’agent le plus sensible pour détecter les enzymes KPC [20] Nous avons précédemment révélé que des isolats de K pneumoniae porteurs de KPC-2 étaient présents chez des patients séjournant dans notre établissement et chez des patients résidant dans des établissements de soins de longue durée [5]. Ces isolats peuvent être difficiles à cause de l’expression enzymatique variable et de la taille de l’inoculum. L’omission de l’ertapénème des tests de susceptibilité commerciale peut également entraver la détection. Ces facteurs ont été documentés avec K pneumoniae contenant des enzymes KPC et rappellent problèmes associés au β-lactame à spectre étendu Détection et reconnaissance [21] Le dilemme est encore aggravé par le manque de microbiologistes sur place dans de nombreux établissements de soins de longue durée et les problèmes de communication avec les travailleurs des laboratoires de microbiologie clinique où des essais hors site sont effectués. Les isolats de K pneumoniae hébergeant des β-lactamases KPC chez des personnes à New York se sont révélés être clonaux, tous les 9 de nos carbapénèmes Le PFGE montre que les E coli résistants ne sont pas apparentés, y compris ceux provenant des mêmes données d’installation [5, 22] Bien que les isolats soient uniformément sensibles à la polymyxine B et à la tigécycline in vitro, les résultats pour les patients infectés restent inconnus L’identification d’isolats d’E. Coli résistants aux carbapénèmes avec des profils de résistance multidrogue peut être un événement sentinelle des tendances futures à long terme. Le personnel travaillant dans des établissements de soins de longue durée peut ne pas connaître de «nouveaux» phénotypes de résistance, phénomène précédemment décrit lors d’une épidémie clonale d’infection à Haemophilus influenzae résistante aux quinolones dans l’une de nos installations [23]. L’absence de clonalité des E. coli résistants aux carbapénèmes identifiés dans notre étude, même au sein d’une même installation, peut indiquer l’émergence d’une telle résistance dans des établissements distincts. Les isolats de E ostéoporose. coli résistants aux carbapénèmes rapportés dans notre étude sont un pas de plus vers la pharmacorésistance extrême et, clairement, la prévention de la pharmacorésistance, particulièrement dans les établissements de soins de longue durée, nécessite une approche multidimensionnelle [24, 25]. indication d’une communication opportune entre le personnel des établissements de soins de longue durée et les travailleurs des laboratoires de microbiologie clinique associés taires, le personnel de contrôle des infections, les pharmaciens et les médecins des maladies infectieuses pour détecter et contrôler un problème inquiétant, peu reconnu et potentiellement en plein essor

Remerciements

Soutien financier Fondation médicale BMA, Fondation Beatrice Snyder et Instituts nationaux de la santé, Institut national des sciences médicales générales, Accès des minorités à la recherche dans les carrières GM008722-07 Conflits d’intérêts potentiels CU siège au bureau des conférenciers pour Wyeth et Astra-Zeneca; PAB et MT sont des employés de Wyeth; SS-M est membre du bureau des conférenciers pour Merck et Ortho-McNeil; WW sert au bureau des conférenciers pour Wyeth; et JJR siège au bureau des conférenciers pour Wyeth et Ortho-McNeil. Tous les autres auteurs: aucun conflit